粘多糖是結締組織細胞間的主要成分,它廣泛存在于各種細胞中,粘多糖是帶陰性電荷的多聚物,它是重要的粘多糖,有硫酸皮膚素,硫酸鈉肝素,硫酸角質素,硫酸軟骨素,透明質酸等。前三者是粘多糖病的主要病理性粘多糖,這些粘多糖都是直鏈雜多糖,由不同的雙糖單位連接而成,包括n乙酰氨基己糖和糖醛酸或者己糖組成。
每個氨基聚糖直連有五十到一百個分子組成,許多直連又同時與一條蛋白質肽鏈結合,更大分子量的聚合體,正常溶酶體中還有許多種糖苷酶,硫酸脂酶和乙酸轉移酶,不同的粘多糖需要不同的溶酶體酶進行降解,已知有十種溶酶體酶參與降解過程,其中任何一種酶的缺陷都會造成氨基葡聚糖鏈分解障礙,在溶酶體內聚集,尿中排出增多,患者出現的酶活性僅為正常人的1%到10%。