神經性厭食的病程差異很大,有半年自愈的,也有數十年不愈的。有研究隨訪發現,40%到50%的可以痊愈,30%的軀體狀況改善,但是仍然有進食和心理問,20%到25%發展為慢性,其中5%到10%死于并發癥或自殺。
與預后良好的相關因素有,發病年齡小、療程短、不隱瞞癥狀、不幼稚,對自己的評價有改變。個體病前的心理、社會適應情況比較好,體重降低不太明顯等。而預后不良多使父母矛盾突出,有暴食、誘吐、腹瀉藥,行為異常,如強迫癥狀、癔癥、抑郁。病前心理社會適應情況差,社會經濟水平低,體重降低過多,對疾病認識不足,發病年齡較大,病程較長者。