當多囊腎患者的腎臟增大到一定程度可以在腹部捫及雙側可以觸及者占到50%到80%,單側可以觸及者為15%到30%,觸診的這個腎臟,質地比較堅實,表面可以成結節狀,隨著呼吸移動,合并感染時可以伴有壓痛,背部疼痛。疼痛是多囊腎患者最常見的早期癥狀之一。
隨著年齡及腎臟增大而增加,女性更為常見,性質可以是鈍痛,脹痛,刀割樣或針刺樣。可以向上腹部,恥骨上放射。另外30%到50%的患者可以有肉眼血尿和鏡下血尿的發生,多為自發性,也可以發生在劇烈運動和創傷以后,引起血尿的原因主要是囊腫壁血管的破裂,結石,感染,癌變。