完全性大動脈轉位如果不伴有其他畸形,則會形成兩個并行循環(huán),也就是上下腔靜脈回流的靜脈血,通過右心設置轉位的主動脈供應全身。而肺靜脈回流的氧和血,通過左心攝入轉位的肺動脈到達肺部,患者必須依靠心內交通或者心外交通將血液進行混合,其中心內小童是指卵圓孔未閉房間隔缺損或者室間隔缺損,而心外交通是指動脈導管未閉或者合并的側支血管。
完全性大動脈轉位的血液動力學改變,主要取決于患者是否伴有其他畸形,左右心血液溝通混合程度以及肺動脈是否狹窄。根據是否合并室間隔缺損以及肺動脈狹窄,可以將此病進行分類。