闌尾炎的鑒別診斷中,要特別注意急性胃腸炎,腸蛔蟲癥,腸套疊、痢疾、急性腸系膜淋巴結炎、原發性腹膜炎和梅克爾憩室炎等相鑒別。還應與其他急腹癥鑒別,如卵巢囊腫扭轉,女性患者右側卵巢囊腫扭轉引起右下腹陣發性劇烈絞痛,腫物可因血液循環障礙,出血壞死而引起有腹肌緊張、壓痛,辨別診斷為直腸指診和雙合診,觸及盆腔內圓形腫物。
梅克爾憇室炎,憩室位于末端回腸距回盲部20到100厘米以內,發炎時壓痛,和肌緊張部位比較靠近中線,如有便血史者,應考慮本病,術前檢查一般不能辨別。手術時若闌尾正常,則應探查回腸,也要與回盲部結核相鑒別。回盲部結核患者全身消瘦,經常有低熱,一般有慢性腹痛時,常可摸到腫物,與急性壞死性小腸炎相鑒別。此病有腹瀉和便血病史,入院時常有高熱,嚴重出現中毒或休克狀態。