叢集體性頭痛的主要臨床表現在發作的時候大多沒有先兆頭痛固定為一側的眼以及眼眶的周圍叢集性頭痛的發作大多是在晚上,最初感覺是一側眼以及眼眶周圍有脹感或者壓迫感在數分鐘之后會迅速地發展為劇烈的脹痛或者酸痛并且會向同側的額顳部和頂枕部進行擴散,同時會伴有疼痛側球結膜的充血、流淚、流涕、出汗眼瞼輕度水腫少數患者可能會出現嘔吐的情況,頭痛的時候患者是十分的痛苦,坐臥不寧,一般會持續十五甚至到180分鐘左右,此后癥狀會迅速消失,癥狀緩解以后患者仍然可以從事原有的活動。
叢集性頭痛的發作特征是呈叢集性發作也就是每天發作,一次到數次每天大約會在相同的時間進行發作有的就會像定時的鬧鐘一樣幾乎在恒定的時間發作每次發作的癥狀和持續的時間幾乎相同,叢集性發作可以持續,數周或到數月后才可以緩解,一般一年會發作一到兩次,有的患者的發病會有明顯的季節性,以春秋季多見,有的患者的緩解期可以持續數月到數年。