外科手術已很少應用于肺結核的治療,大于3厘米的結核球與肺癌難以鑒別時,復制的單側纖維厚壁空洞,長期內科治療未能使痰菌轉陰者或單側的毀損肺伴支氣管擴張,以上是功能病有反復的咳血或者繼發感染者,可做肺葉或者全非的切除。結核性膿胸和支氣管胸膜漏,經內科治療無效且伴同側活動性肺結核宜作肺葉胸膜切除術。
手術的禁忌癥,有支氣管黏膜活動性結核病變,而又不在切除范圍之內的全身狀況差,或有明顯的心肺腎肝功能不全者,只有藥物治療失敗無效時才考慮手術,手術前后病人無例外,也要應用抗結核藥。結核手術治療的主要有空洞性肺結核手術結核球手術,毀損肺手術,肺門或縱隔淋巴結手術,大咯血急診手術。