全消化道造影檢查隨著鋇劑在消化道內的流動,然后可以觀察上消化道,小腸以及右半結腸的病變。一般來說,主要是懷疑小腸病變,比如小腸的蠕動異常,動力異常,或者是小腸器質性疾病時,來選擇全消化道造影。因為上消化道可以通過胃鏡檢查或者上消化道鋇餐檢查,下消化道可以通過結腸鏡或者是鋇灌腸檢查來發現疾病,但是小腸只能夠通過全消化道造影,或者是膠囊內鏡檢查。
在過去認為小腸疾病是內鏡檢查的盲區,所以只能夠通過全消化道造影來觀察小腸病變,但是現在除了膠囊內鏡以外,還有小腸鏡。不過小腸鏡的選擇,一般是先通過全消化道造影或者是膠囊內鏡,發現了可疑病變,需要取活檢才做小腸鏡,因為小腸鏡花費比較大,病人痛苦也相對較大。