缺血性腸炎的治療應以治療原發疾病為主,如心功能正常時,則盡可能的撤去造成腸系膜血管收縮的藥物,如洋地黃和血管加壓素。對于沒有明確藥物使用禁忌的中老年患者,可給予復方丹參片改善微循環。
此外,對于已發生嚴重腸功能紊亂的患者應給予積極的對癥治療,如腸脹氣者給予腸管排氣減壓和經鼻飼管抽氣減壓。惡心、嘔吐者給予止吐藥和胃腸動力藥,腹瀉者給予腸道黏膜保護劑,如思密達、次碳酸鉍劑,解痙劑如阿托品、山莨菪堿等。
糖皮質激素對缺血性病變恢復沒有幫助,且有促發腸穿孔的可能,因此不提倡使用,多數患者經內科保守治療后可以很快好轉,但是也有少部分患者病情惡化,會發生腸壞死,這個時候應行急診手術治療。