發熱是感染性心內膜炎最常見的癥狀,幾乎所有的患者都有過不同程度的發熱,熱型不規則,個別患者無發熱。患者有盜汗、食欲不好、體重減輕、關節痛、皮膚蒼白等表現,病情進展緩慢,80%到85的患者可聞及心臟雜音,可有基礎心臟病和心內膜炎導致瓣膜損害所致。無心臟雜音可出現音樂樣雜音,約一半患者由于中毒性心肌炎等導致充血性心力衰竭的。
栓塞部位不同而出現不同的臨床表現,一般發生于病程后期,大約三分之一的患者為首發癥狀,皮膚栓塞可見散在的小淤點,肺部栓塞可有胸痛、咳嗽、咯血、肺部啰音,腦動脈栓塞可有頭痛、嘔吐、失語、抽搐甚至昏迷等。