首先尿路感染應與腎結核相鑒別,腎結核的患者往往尿路刺激癥狀,如尿頻、尿急、尿痛的癥狀不是很明顯,患者使用抗生素治療常常是沒有效果?;颊叩目菇Y核桿菌實驗的往往是陽性,普通的細菌學檢查往往無法培養出來細菌,此外患者可能伴有肺結核的癥狀比如低熱,咳嗽咳痰這種情況。
第二,要與急性尿道綜合征相鑒別,急性尿道綜合癥常見于老年人,患者有尿路刺激癥狀但是尿里面并沒有細菌和膿性尿,此外還可以與無癥狀性的細菌尿相結合,患者尿里面有細菌,但是沒有尿頻、尿急、尿痛等癥狀。
最后還可以全身性的感染疾病相鑒別,這類的病人了往往有全身的反應,比如胃寒、發熱、惡心、嘔吐的癥狀,但是尿路局部癥狀不明顯。