一般來說,慢性腎衰竭患者的內分泌功能通常出現紊亂,垂體,甲狀腺和腎上腺功能通常是相對正常的,患者存在感染時,可以發生腎上腺皮質功能不全,血漿腎素可正常或輕度升高,骨化三醇降低,紅細胞生成素降低,腎臟是多種激素的降解場所,如胰島素,以及甲狀旁腺激素,腎衰竭對其作用是使其作用延長。
女性患者的雌激素水平降低,性欲差,腎衰竭患者時可能會出現閉經、不孕,個別早期腎衰竭患者即使懷孕,胎兒多發育不良,流產率較高,透析后多可以恢復正常的月經來潮,而男性的腎衰竭患者性欲缺乏和陽痿,透析后可能得到一定改善,這種疾病使血漿睪丸素水平下降,促性腺激素水平可以稍微增高,但患者的陽痿使用睪丸素治療后通常是無效的,另外男性患者的慢性腎功能衰竭通常出現精液減少,精子數目減少,精子活動力較差。