口腔局部疾患是主要導致口臭的原因，但不容忽視的是口臭也常是某些嚴重系統性疾病的口腔表現，有一些器質性疾患，也會導致口臭癥，分為病理性口臭和生理性口臭，病理性口臭分為口源性口臭和非口源性口臭。
據統計80%到90%的口臭是來源于口腔，口腔中有未治療的齲齒、殘根、殘冠、不良修復體、不正常的解剖結構，牙齦炎、牙周炎及口腔粘膜病等都可以引起口臭，其中齲齒和牙周疾病是最常見的相關疾病。
而非口源性的口臭是口腔鄰近組織疾病，如化膿性扁桃體炎、慢性上頜竇炎、萎縮性鼻炎等，可以產生膿性分泌物而發出臭味。臨床上常見的內科疾病如急慢性的胃炎、消化性潰瘍出現酸臭味，幽門梗阻、晚期胃癌常出現臭鴨蛋性的口臭。
生理性口臭是饑餓、使用了某些藥物或者是洋蔥、大蒜等刺激性食品，抽煙、睡眠、唾液分泌量減少所致的，細菌大量分解、食物殘渣等都可能引起短暫的口臭。
而對于口臭的治療，口臭并不可怕，只要查明原因是可以治療的。首先考慮口臭是口源性還是非口源性的，對于不能排除與口臭相關的因素，如呼吸系統疾、消化系統疾病、實質臟器損害、或者是糖尿病性酮癥和尿毒癥、白血病、維生素缺乏等，則應該先對這些疾病進行局部或全身的系統治療，之后口臭也會得到治愈。
