亞急性感染性心內膜炎最常見的發病因素,亞急性者主要發生于器質性心臟病,首先為心臟瓣膜病,尤其是二尖瓣和主動脈瓣,其次為先天性心血管病如動脈導管未閉、法洛四聯癥和主動脈縮窄。
墜生物位于湍流的下游,如二尖瓣關閉不全的瓣葉心房面、主動脈瓣關閉不全的瓣葉心室面和室間隔缺損間隔的右心室,可能與這些部位的壓力下降和內膜灌注減少,有利于微生物沉積和生長有關。
高速的射流沖擊心臟和大血管內膜處,可致局部損傷如二尖瓣返流面對的左心室,主動脈返流面對的二尖瓣前葉。
壓差小的部位和房間隔缺損血流緩慢時,房顫心衰少見,瓣葉狹窄時較關閉不全少見。