迄今為止原發性的iga腎病病的病因尚未完全闡明,多種因素均參與iga腎病的發生以及進展。目前研究認為系膜區的iga沉積物主要是以多聚的iga1為主,iga1分子的糖激化異常可以造成iga1易于自身聚集或者是被igg和iga識別形成免疫復合物,這一過程可能是iga腎病發病中的始動因素,多聚的iga1分子合成釋放在外周血中的持續存在,與腎小球系膜細胞結合,并在系膜區沉積,觸發炎癥反應,從而導致腎小球細胞增生,腎小球硬化,小管萎縮和間質纖維化。上述疾病發生發展過程中,均有遺傳因素參與或者是調節的可能。
其他系統性疾病也可以導致腎小球系膜區iga沉積,比如過敏性紫癲、病毒性肝炎、肝硬化、干燥綜合癥、系統性紅斑狼瘡、強直性脊柱炎、類風濕關節炎、混合性結締組織病、結節性多動脈炎、結節性紅斑、銀屑病、潰瘍性結腸炎、腫瘤、艾滋病等稱為繼發性的iga腎病。