對于遷延性慢性腹瀉的病因診斷必須要注意詳細的詢問病史,并且進行全面體格檢查,同時要選用有效并且正確的輔助檢查,包括糞便常規、腸道菌群分析、大便酸度、還原糖和細菌培養。
有條件者還要進行十二指腸液檢測,分析它的ph值,胰蛋白酶、糜蛋白酶,腸激酶及血清抗胰蛋白酶以判斷蛋白質的消化吸收能力,可以測定十二指腸液的脂酶和淡鹽濃度,以了解脂肪的消化吸收狀況。
還可進行寄生蟲抗原和寄生蟲卵的檢測,小腸黏膜活體組織檢查是了解慢性腹瀉病理生理變化的最可靠方法,必要時還可做蛋白質糖類和脂肪的吸收功能實驗,x線結腸鏡等檢查綜合分析判斷。