小腸中有少數蛔蟲感染時可無癥狀,稱蛔蟲感染者,大量感染時而引起的疾病稱為蛔蟲病。腸道蛔蟲常引起反復發作的上腹部或臍周腹痛,由于蟲體的機械性刺激及其分泌的毒物和代謝產物可引起消化道功能紊亂和異性蛋白反應,如納差、惡心、嘔吐、腹瀉和蕁麻疹。
兒童嚴重感染者可引起營養不良、精神不安、失眠、磨牙、夜驚等,腸內蛔蟲一般處于安靜狀態,但受到各種刺激如高熱、消化不良、驅蟲不當等,導致蛔蟲騷動及穿孔,可引起嚴重的并發癥。常見的有膽道蛔蟲癥,蛔蟲性腸梗阻以及傷寒和少數胃十二指腸潰瘍病患者,感染后造成蛔蟲穿過病變處常閉而引起的穿孔產生彌漫性腹膜炎。