急性腎盂腎炎大體表現為:腎臟腫脹充血,腎盂擴張,嚴重者可形成腎盂積濃,腎盂粘膜充血和出血,嚴重者形成膿苔和潰瘍。
腎實質充血,其間可見黃色放射狀條紋和小膿腫,病變分布不均勻,可呈單側性發病,接近腎盂的腎髓質病變最為嚴重。
而血源性腎盂腎炎呈雙側性分布,遍布彌散的栓塞性小膿腫,光鏡下面可以發現腎盂和腎髓質病變較腎皮質嚴重,腎盂黏膜和腎間質充血、水腫,中性粒細胞浸潤,嚴重者可見小膿腫形成。
腎小管上皮細胞空泡及顆粒變性,管腔內可以見到中性粒細胞充填以及形成粒細胞管型,部分腎小管上皮細胞崩解而脫落,免疫病理和電鏡檢查無特殊診斷意義。