腦內5-羥色胺具有廣泛的功能,參與情緒調節、覺醒睡眠周期、痛覺、體溫、性行為、夢和下丘腦垂體的神經內分泌活動的調節。
雙相情感障礙的5-羥色胺假說是比較重要的一個假設。這個假說認為5-羥色胺直接或間接的參與了人的情緒調節,5-羥色胺功能活動降低與抑郁發作患者的食欲減退、失眠、晝夜節律紊亂、內分泌功能失調、性功能障礙、煩躁不安、不能應對應激、活動減少等密切相關。
而5-羥色胺功能增高則和躁狂發作有關,大量資料提示,中樞的5-羥色胺神經遞質的變化和相應的受體功能改變與雙相情感障礙的發生有關系。
5-羥色胺缺乏可能是雙相情感障礙神經生化基礎,是醫患雙相情感障礙的標記。但是,僅有5-羥色胺缺乏并不一定導致疾病,需要有去甲腎上腺素異常才能表現的一個臨床癥狀。