腦膿腫在經歷炎癥期、化膿期、包膜形成期三個階段之后,在膿腫尚未完全局限前首先采用抗生素治療,促進炎癥的局限,并可能使部分腦膿腫得到治愈;膿腫形成包膜之后應該以手術治療為主,感染不能有效控制或顱內壓急劇增加的時候,應該立即開顱,切除腦膿腫,并放置引流管,根據細菌培養或者藥敏實驗來選擇敏感的抗生素,在細菌培養結果沒有出來之前一般都是選用抗生素廣譜,易通過血腦屏障的藥物。
靜脈用藥的時間不應該少于兩到四周,立體定向腦膿腫穿刺引流為腦膿腫形成之后首選的治療方法,對于膿腫體積大于10毫升,膿液黏稠不易抽出或者應該置管引流,每日抗生素鹽水沖洗,全身應用抗生素,開顱腦膿腫切除在包膜形成之后進行。