確定細菌感染前必須進行大便培養,由于大便培養需要至少三天才能得到結果,因此可以先用抗生素,待培養結果出來后再考慮繼續停止或者更換抗生素;另外如果孩子得了細菌性腸炎,停止用抗生素的時機并不是根據大便的顏色和性狀,若開始使用抗生素就應該連續使用至少五到七天,再次化驗大便,如果化驗結果正常就可以停藥,否則需要繼續服用直到檢測正常為止,千萬別見好就收,造成慢性腸炎細菌耐藥。
抗生素可殺滅腸道內致病菌,同時也殺滅對人體有益的腸道細菌,所以細菌性腸炎時除了服用抗生素還需要服用益生菌制劑,但抗生素與益生菌服用至少間隔2小時,避免抗生素與益生菌相互作用相互抵消;益生菌本身也可以抑制腸道內致病菌生存并抵消部分毒性,對治療也有幫助,如果沒有全身中毒性癥狀、高熱不退、極度疲憊或休克的前期表現,使用抗生素最好還是需要口服,口服抗生素進入腸道作用及時,不要迷信靜脈輸注抗生素;不要使用止瀉藥,早些排出細菌和毒素,疾病好轉更快,有時還需要導瀉或者灌腸。