五羥色胺可以直接或間接參與心境調節,它的功能活性降低與抑郁障礙的或者是抑郁癥的發生有關系,通過研究發現三環類抗抑郁藥和選擇性五羥色胺再攝取抑制劑,可以通過抑制五羥色胺的重吸收發揮抗抑郁作用合成五羥色胺的前提。
五羥色胺抑郁癥具有治療作用,可以抑制五羥色胺降解的單胺氧化酶抑制劑也具有抗抑郁作用,抑郁癥患者的腦積液中五羥吲哚乙酸代謝物含量比較正常人低,他的濃度與抑郁癥的嚴重程度成一個負相關,并且與主動性攻擊性和自殺行為有關,而且五羥吲哚乙酸含量會隨著疾病轉歸而改變。
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