潰瘍性結腸炎的病理表現主要有以下這些,病變早期有黏膜彌漫性炎癥,可見水腫充血與灶性出血。黏膜呈彌漫性細顆粒狀,組織變脆,觸之易出血。黏膜及黏膜下層有淋巴細胞、漿細胞、嗜酸性及中性粒細胞浸潤,以后因腸腺隱窩底部聚集大量中性粒細胞及形成小的隱窩膿腫,當隱窩膿腫融合、潰破、黏膜隨即出現廣泛的淺小不規則潰瘍,并可逐漸融合成不規則的大片潰瘍。
由于結腸病變一般限于黏膜與黏膜下層,很少深入肌層,所以并發結腸穿孔、瘺管或周圍膿腫者比較少見,結腸炎癥在反復發作的慢性過程中,大量新生肉芽組織增生出現炎性息肉,黏膜因不斷破壞和修復其正常結構喪失,纖維組織增生,有腺體變形,排列紊亂,數目減少等萎縮性改變,由于潰瘍愈合、瘢痕形成、黏膜肌層與肌層肥厚,使結腸常變形縮短、結腸袋消失,甚至腸腔縮窄。