偏頭痛的患者為了確定病因是要做常規的尿常規的檢查、大便常規的檢查、血常規的檢查和生化檢查等。
另外,偏頭痛的患者還要進行腦電圖的檢查,認為偏頭痛的病人無論是在發作期或者間歇期,腦電圖的異常發生率都要比正常的人要高的多,但是偏頭痛的病人在腦電圖的改變是不具有特異性的,因為可以出現正常的波形,普通性的慢波、急波、放電、局灶行急波、類型以及對過度通氣、閃光刺激有異常反應等各種波形。小兒偏頭痛腦電圖的異常率較高,可以達到9%到70%不等,可以出現急波、慢波、快波活動以及彌漫性慢波等。
可以對患者進行腦血流圖的檢查,在病人的發作期和間歇期腦血流圖的主要變化是兩側波幅不對稱,一側偏高或一側偏低。
可以進行腦血管造影檢查,原則上偏頭痛的病人是不需要進行腦血管造影,只有在嚴重的頭痛發作,高度懷疑是否為蛛網膜下腔出血的病人才會進行腦血管的造影,以期除外有顱內動脈瘤動脈畸形等疾患,偏頭痛病人腦血管造影絕大多數是正常的。還可以進行腦脊液的檢查以及免疫學的檢查,還有血小板機能的檢查。