屏障有以下兩方面作用:
1、從解剖學觀點上看,這個結構是限制血液與腦之間的物質自由交換的一個系統,能選擇性的將營養物質由血管內吸收代謝產物轉運至血液中腦部毛細血管,結構與周圍毛細血管結構不同的血管內皮細胞之間相互交集不存在小孔,腦部毛細血管周圍間隙較其他部位血管周圍間隙較小,腦部神經細胞間隙約85%的腦毛細血管周圍有神經膠質細胞包繞。
2、從生理學觀點看,這個結構具有體液調節的功能和保護腦的功能,在病理狀態下,平常容易受到破壞,例如腫瘤炎癥等致病因素均可以使血腦屏障通透性加大,各種原本不應透過的物質都能自由進出神經系統,這時屏障作用也就消失。