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福建醫科大學附屬第二醫院第二臨床醫學院是泉州地區現代醫學的發祥地，迄今已走過一百二十六年的歷程，現已發展成為我省主要的醫療、教學、科研基地之一，是閩南地區最早的一所三級甲等綜合性醫院及博士、碩士研究生學位授權點單位。醫院始建于1881年，為英國教會醫院，原名“惠世醫院”，解放后，改為晉江專區第二醫院。1973年升格為福建醫科大學附屬第二醫院。2000年成為福建醫科大學第二臨床醫學院，2002年成為福建醫學會風濕病學分會主任委員單位。醫院倡導科學精神與人文精神相結合的治院方略，歷來以外科技術精湛著稱，上世紀四、五十年代率先在泉州地區開展大、中型外科手術，并為泉州地區培養了大批醫學骨干力量。近二十年來，內科領域在相關學科帶頭人開拓領導下，學科建設長足發展，多個二級專業躍入省內先進水平，其中自身免疫風濕病專業省內領先。現任院長是我省自身免疫風濕病學科帶頭人、博士生導師、國家衛生部有突出貢獻中青年專家。

醫院原址地處歷史文化名城---僑鄉泉州，占地23.07畝，建筑面積44557平方米，2006年市政府在東海組團劃撥142.6畝建設我院“東海分院”，該項目現已納入泉州市十一五發展規劃，列為重點項目。

醫院病床編制670張，在編職工1046人，具備高級職稱186人，其中正、副教授91人，有博士研究生導師4人、碩士研究生導師35人，享受國務院特殊津貼專家4人、衛生部有突出貢獻中青年專家1人。擔任專業學會主任委員1人，各專業學會副主任委員（副會長）20人、常務委員（常務理事）30人、委員（理事）86人。

醫院科室門類齊全，設有急診科、內一科、免疫與血液內科、內二科、呼吸內科、神經內科、特需內科、康復科、華僑干部病房、兒科、中醫科、骨科、普外科、腫瘤與心胸外科、泌尿外科、神經外科、婦產科、特需產科、耳鼻咽喉科、眼科、口腔科、皮膚科、特外一、特外三、手術室、麻醉科等27個臨床科室、35個二級專科，還設有11個醫技科室、ICU、CCU和20個職能科室。在風濕免疫科、超聲醫學科、心血管科、呼吸內科、普外科、泌尿外科、骨科、內分泌科、耳鼻喉科、腎內科、肝膽外科、胸外科、消化道腫瘤外科、整形外科、婦產科和眼科等專科尤為專長。自身抗體譜檢測及內分泌激素測定項目齊全。醫院在開拓醫學新領域、探索新技術新療法方面一直處于領先地位，幾十個新的診療技術達到國內或省內先進水平，如微創外科技術、支氣管鏡介入診療技術、超聲介入診療技術、心血管超聲診斷、放射學介入診療技術、腎移植、角膜移植、全喉切除發音重建術、人工椎體轉換術、臂叢神經損傷修復術、體外循環心內直視手術、腦干腫瘤摘除術、斷指再植術等。優秀的人才、精良的設備和設置齊全的醫學專科為廣大民眾提供了全方位的醫療、保健服務，醫院目前年門診量50多萬人次、年住院量超過2萬人次、完成各類手術1.6萬余臺。

此外醫院設有自身免疫病研究室、介入超聲研究室、肝膽研究二室、耳鼻喉研究三室、手外科研究室、糖尿病研究室、腎病研究室、骨科生物力學研究室、睡眠呼吸研究室等9個研究室，其研究領域廣泛，研究程度涉及細胞水平及分子水平，2001年以來共有28項科研項目獲得醫學科學技術進步獎，96項研究項目得到政府或研究基金的資助，有1230篇論文發表于國內外學術期刊。醫院作為福建醫科大學第二臨床醫學院及省級醫學繼續教育基地之一，還設有12個醫學教研室，并于1998年開始招收全國統招碩士研究生、2003年招收全國統招博士研究生，迄今已招收博、碩士研究生113人。

1981年，經省政府批準，醫院在本省率先建立華僑門診、華僑病區。二十多年來接受大量來自美國、日本、新加坡、菲律賓、印度尼西亞、香港、臺灣及其他東南亞地區的病人。愛國僑胞熱心桑梓、慷慨解囊為醫院的建設作出了積極的貢獻。福建醫科大學附屬第二醫院歷任領導及全體同仁都非常珍視廣大僑胞及社會各界對該醫院的關愛及支持。

“博大精深仁心惠世”為百年老院的當代院訓。醫院將繼續發揮人才優勢，發揚良好的醫德醫風，提高醫療服務質量，堅持以“病人為中心”的服務宗旨，為廣大患者提供優質的醫療服務。

醫院擁有全身螺旋CT、全身MRI、數字減影心血管造影裝置（DSA）、直線加速器、模擬定位機、數字化胃腸造影機、多功能數字X光機、眼底及脈絡膜熒光造影儀、心臟、腹部及周圍血管彩色多普勒超聲診斷儀、黑白B超機、體外震波碎石機、集束電極射頻治療系統、連續性腎臟替代治療儀、電子胃鏡、電子腸鏡、電子支氣管鏡、24小時動態心電圖儀、24小時動態血壓監測儀、活動平板儀、24小時腦電圖機、多功能視誘發電位儀、各種聽覺檢查設備、肌電圖機、體外循環機、全自動免疫分析儀、全自動生化分析儀、全自動血球計數儀、全自動細菌檢測培養儀、流式細胞分析儀、全自動血凝儀、乳腺X光機、全身骨密度儀、高壓氧艙、麻醉機、呼吸機、各種手術顯微鏡及ICU、CCU監護系統等大型先進設備和齊全的常規檢查設備，總價值達1.12198億元（不含MRI），其中50萬元以上設備有38臺。