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廈門市口腔醫院是廈門市唯一的一家口腔專科醫院，三級達標醫院。醫療設備先進，技術力量雄厚。全院擁有進口口腔綜合治療機100余臺，職工總人數180余人人，其中研究生以上學歷22人，本科以上學歷約占70%，副主任醫師以上職稱26，碩士研究生導師3人，廈門市醫學學術帶頭人2人，有2個廈門市重點學科。擔負著福建醫科大學研究生、本科生及廈門醫學高等專科學校的臨床教學任務。
醫院嚴格按照衛生部三級專科醫院設置標準，設有4個一級科室，包括口腔內科，口腔外科，口腔修復科，口腔正畸科。在此基礎上，口腔內科又分為牙體牙髓、牙周病、黏膜病、兒童口腔預防保健科四個二級分科;口腔修復科分為口腔活動義齒、口腔固定義齒、義齒技工中心三個二級分科;口腔外科分為口腔外科門診、口腔頜面外科病房、手術室、口腔種植中心四個二級分科。設急診科、放射科、檢驗科、消毒配送中心、病理科等輔助科室及用于科研的口腔醫學研究所。
醫院嚴格遵守衛生部《臨床技術操作規范》，臨床上規范診療規范操作，并與國內外先進技術接軌，引進并應用了一系列先進的口腔治療儀器、技術和方法。如：丹麥產根管測量儀、鎳鈦根管擴大系統、烤瓷機、意大利產高頻離心鑄造機、點焊機、德國平衡研磨儀、口腔內窺鏡、法國產全景X光頭顱測量儀、RV機、CCD數學攝像網絡等精密儀器。如鎳鈦根管治療技術，根尖手術，根管長度測量儀，口腔內窺鏡，牙周病誘導再生治療術，根管刮治術，口腔黏膜癌前病變早期治療，烤瓷體修復，磁性附著體鑲牙技術，隱形義齒修復，口腔種植技術，牙體再植及牙體移植術，口腔頜面外傷，口腔頜面腫瘤切除術，兒童牙病無痛性治療，兒童牙病預防，兒童、青少年、成人方絲弓、直絲弓矯治術[以糾正牙列不齊、牙列擁擠、反牙合(地包天)、深覆牙合深覆蓋(暴牙)等，改善患者面形，給患者一副整齊、健康、美麗的牙齒]。同時，醫院擁有自己的義齒制作中心，承擔著院內外各種烤瓷牙等固定及各種可摘義齒的制作和加工。醫院引進兩條意大利手機消毒線，嚴格按照衛生部有關《口腔器械消毒技術操作規范》，做到一人一機，一物一用一消毒(滅菌)，杜絕交叉感染。
近年來有22項科研立項，其中9項科研成果獲得省、市科技進步獎。出版6本專著，擁有3位中華口腔專業委員會委員。醫院先后舉辦了“世界牙科聯盟會議”、“國際色彩學研討會”、“全國粘膜病學術研討會”、“閩臺口腔醫學學術研討會”、“全國口腔工藝規范教材編寫會”等大型全國性學術會議。5年來有200多篇文章刊登在口腔醫學雜志上。2002年成立了廈門市口腔醫學研究所，將醫療、教學、科研與先進的技術有機結合起來，提高了廈門地區口腔醫學的醫、教、研水平，加大了醫院與全國高校的橫向聯系及同國內外醫學院、科研院所在醫、教、，研等方面進行高水平的合作與交流。
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