感染性心內膜炎的基本診斷標準為陽性血培養兩次且為同一致病菌、一般化驗檢查紅細胞和血紅蛋白降低等。
1、陽性血培養：血培養陽性兩次且為同一致病菌，陽性血培養是診斷本病的最直接的證據，而且還可以隨訪菌血癥是否持續，取血時間以寒戰或體溫驟升時為佳，每次取血應用更換靜脈穿刺的部分，皮膚應嚴格消毒。常規應作需氧和厭氧菌培養，在人造瓣膜置換，較長時間留置靜脈插管、導尿管或有藥癮者，應加做真菌培養。一般作靜脈血培養，動脈血培養陽性率并不高于靜脈血。罕見情況下，血培養陰性患者，骨髓培養可陽性。培養陽性者應作各種抗生素單獨或聯合的藥物敏感試驗，以便指導治療。
2、一般化驗檢查：紅細胞和血紅蛋白降低，后者大都在6％～10g％左右，偶可有溶血現象，白細胞計數在無并發癥的患者可正常或輕度增高，有時可見到左移，紅細胞沉降率大多增快，半數以上患者可出現蛋白尿和鏡下血尿。
在并發急性腎小球腎炎，間質性腎炎或大的腎梗塞時，可出現肉眼血尿，膿尿以及血尿素氮和肌酐的增高，腸球菌性心內膜炎常可導致腸球菌菌尿，金葡菌性心內膜炎亦然，因此作尿培養也有助于診斷。
感染性心內膜炎以藥物抗感染治療為主，如在醫生指導下使用注射用阿莫西林鈉、注射用頭孢曲松鈉等藥物進行治療。
