自閉癥常見的病因是遺傳因素、感染與免疫因素和孕期理化因子刺激因素等。
一、遺傳因素:目前已知與自閉癥疾病相關的染色體基因有十個,若父母中有自閉癥患者,傳給孩子的概率高達80%~90%,孤獨癥在單卵雙生子中的共患病率高達61%~90%,在兄弟姊妹之間的再患病率在4.5%左右,由此可見遺傳因素是自閉癥的重要病因。
二、感染與免疫因素:在過去的研究中發現,孕婦患病毒感染后,其子代患自閉癥的概率會變大,與該病因相關的病原體有風疹病毒、巨細胞病毒、水痘帶狀皰疹病毒和梅毒螺旋體等,這些病原體可由胎盤進入胎兒體內,與胎兒正在發育的神經系統發生交叉免疫反應,從而影響了神經系統的正常發育,有可能會導致自閉癥的發生。
三、孕期理化因子刺激:孕早期的孕婦如果有反應停和丙戊酸鹽類抗癲癇類藥物的用藥史以及酗酒等,會致使子代自閉癥的發生概率提升。