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基因突變檢測的臨床應用

概述:

基因突變檢測在臨床上主要可以用于疾病的早期篩查、診斷及預后判斷。

1、多種惡性腫瘤,如惡性黑色素瘤、甲狀腺癌、結直腸癌、肺癌等存在不同比例的B-raf基因突變;

2、結直腸癌、胰腺癌、肺癌等存在不同比例的K-ras基因突變。

3、良性腫瘤的患者若是檢出B-raf或K-ras基因突變,提示有腫瘤惡變的可能。

4、PIK3CA基因突變檢測,對肺癌、乳腺癌、結直腸癌等腫瘤患者的早期篩查、診斷及預后具有重要意義。

基因突變檢測的認知:

 基因突變檢測是指通過建立一系列電泳,分析DNA構象或解鏈特性,或者利用DNA變性和復性等特性,進行DNA突變的分析。

常用方法:

1、聚合酶鏈反應-限制性片段長度多態性分析技術。一般用于檢測已知的突變位點。

2、焦磷酸測序法。基本原理是雙脫氧終止法,是進行基因突變檢測的可靠方法,也是使用最多的方法。但其過程繁瑣、耗時長,靈敏度不高,對環境和操作者有危害,故在臨床應用中存在一定的限制。

3、單鏈構象異構多態分析技術。依據單鏈DNA在某一種非變性環境中具有其特定的第二構象,構象不同導致電泳的遷移率不同,從而將正常鏈與突變鏈分離出來。與測序法相比,靈敏性更高。

4、探針擴增阻滯突變系統。是利用Tap DNA聚合酶缺少3′到5′外切酶活性,聚合酶鏈反應引物的3′端末位堿基必須與其模板DNA互補才能有效擴增的原理。通過設計適當的引物以檢測突變基因。

5、高效液相色譜法。是基于發生錯配的雜合雙鏈DNA與完全匹配的純合雙鏈DNA解鏈特征的差異而進行檢測的,可檢測出含有單個堿基的置換、插入或缺失的異源雙鏈片段。與測序法相比,該法簡單、快速,不僅可用于已知突變的檢測,還可用于未知突變的掃描。但只能檢查有無突變,不能檢測出突變類型,結果判斷容易出錯。

6、微數字聚合酶鏈反應。該方法為將樣品作大倍數稀釋和細分,直至每個細分試樣中所含有的待測分子數不超過1個,再將每個細分試樣同時在相同條件下聚合酶鏈反應后,通過基因芯片逐個計數。該方法為絕對定量的方法。

7、高分辨率熔解曲線分析技術。利用不同長度或不同堿基組成的DNA序列溶解曲線不同的原理,在聚合酶鏈反應后直接運行高分辨率熔解即可完成對樣品突變分析。該技術是一種靈敏度100%的表皮生長因子受體基因突變篩選技術,可用于體細胞突變的檢測。

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