首先,橋本氏甲狀腺炎和亞急性甲狀腺炎的病程不同。橋本氏甲狀腺炎是緩慢起病,一般有起病發展到病程后期出現甲狀腺功能減退,需要數年甚至數10年的時間。而亞急性甲狀腺炎是一種急性的病毒感染的甲狀腺疾病,起病比較急,病程較短,一般在數月到半年,也有的少數病例可以達到1年。
第二,病因不同,橋本氏甲狀腺炎的病因是由于機體內存在著甲狀腺自身免疫性的抗體,甲狀腺組織中有淋巴細胞的浸潤,導致了甲狀腺濾泡細胞的破壞,使甲狀腺功能受損。而亞急性甲狀腺炎是由病毒感染所引起,大多由腺病毒,流感病毒,腮腺炎病毒以及柯薩奇病毒引發。
第三,在治療上也不一樣,亞急性甲狀腺炎在治療時,輕癥患者使用非甾體類的抗炎藥,中重型的患者使用糖皮質激素來治療。而橋本氏甲狀腺炎在初期沒有發生甲狀腺功能減退的時候是不需要治療的,到了病程的中后期,有些病人會出現甲狀腺功能的減退,這個時候使用甲狀腺激素替代治療。