腎結核病理在臨床上分為病理腎結核和臨床腎結核,病理腎結核主要是指結核桿菌經血行感染進入腎臟后,由于腎皮質的血液循環豐富,修復力強,如果患者的免疫功能良好,感染細菌的數目少或毒力小,這種早期微小結核病變是可以自行愈合的,臨床上常不會出現癥狀,因此稱為病理腎結核。
如果患者的免疫功能低下,細菌數量大或毒力較強時腎內的病灶不愈合,逐漸擴大,結核桿菌經腎小管到達腎髓質,由于該處血流緩慢,血循環差,易發展為腎髓質結核,此病變在腎髓質內繼續發展穿破腎乳頭到達腎盞,腎盂,發生結核性腎盂腎炎,并且出現臨床癥狀及影像學改變,這時稱為臨床上腎結核。