對于直徑小于兩公分,且表現典型的無癥狀性的松果體囊腫進行臨床隨訪,并且每年至少進行一次影像學的檢查。對于引起癥狀的病變或者是磁共振表現發生變化的病變,建議手術緩解癥狀或明確診斷,腦積水患者的手術選擇是:
第一種行腦脊液分流術,但是部分患者無法緩解凝視障礙。
第二種是切除腫瘤,緩解癥狀和明確診斷,手術切除的并發癥發生率相對較低。
第三種治療方法是立體定向和內鏡下抽液,但是這種方法可能無法得到明確的診斷所需要的足夠的組織。
第四種治療是內鏡下第三腦室造瘺術,適用于典型的松果體囊腫,因為無法獲得組織進行診斷,可以采用此方式。