目前認為和基因遺傳有一定的關系。所謂的基因遺傳是指患有該病的患者大多數攜帶HLA-B27這類基因,尤其是與B2704、B2705和B2702呈正相關。
除了這些易感基因以外,強直性脊柱炎患者發病一般是與病原體感染有關,主要是泌尿生殖道沙眼衣原體,志賀菌或者是沙門菌等特殊病原體感染。這些感染激發了人體的炎癥應答和免疫應答,從而造成了組織損傷,而導致強直性脊柱炎發病,但是里面的具體發病機制現在還不是非常清楚。
強直性脊柱炎是一種慢性自身炎癥性疾病,多數患者預后良好,少數患者可以發生嚴重的脊柱畸形和關節強直。