脊髓栓系往往會給患者帶來極大的危害。臨床上主要表現為患者的腰骶部出現局部皮膚的改變,容易導致出現隱性脊柱裂、脊膜膨出,以及出現局部皮膚色素沉著,毛發增多的情況。另外,還會導致患者發生脊柱后凸或側彎畸形。有的患者出現明顯的下肢肢體運動功能障礙,主要表現為出現肌肉無力,肌張力增高,出現明顯的異常步態。有的患者還會出現馬蹄內翻足。
除了影響到肢體的運動功能以外,還會導致患者的感覺功能障礙,表現為患者的下肢和會陰部出現感覺異常,并且伴有疼痛。還容易導致括約肌功能障礙,表現為出現排尿困難,尿潴留,尿失禁等情況發生。