對于較為嚴重的腦干損傷,尤其是原發性腦干損傷的患者,在受到損傷以后,患者往往表現為出現嚴重的昏迷狀態,多數患者呈深度昏迷,明顯的一些基礎性反射消失,并且昏迷時間較久,有的患者甚至可能會出現長期植物生存狀態。
其次表現為患者的眼球運動和瞳孔發生改變,部分患者出現明顯的眼球運動功能障礙,以及雙側瞳孔不等大、不等圓,可能會出現瞳孔極度縮小。另外還表現為一側或者雙側瞳孔直接對光反射、間接對光反射消失。
另外,當發生中腦部位損傷的情況下,會造成患者出現去皮質強直。有些患者還可能會表現為出現錐體束征,同時伴有生命體征的變化。