再生障礙性貧血的發生和免疫因素有著很大的關系。很多因素都可以導致機體免疫機制的異常,然后有可能會損傷造血干細胞或者是骨髓造血的微環境,從而有可能會導致再生障礙性貧血的發生。
造血干細胞減少或者有缺陷,是再障的主要發病機理,很多因素都有可能造成造血干細胞的損傷,比如說一些藥物因素,或者是苯及其衍生物,都有可能損傷骨髓的造血干細胞,導致再生障礙性貧血的發生。骨髓造血微環境的缺陷,也是導致再生障礙性貧血的非常重要的原因。造血微環境是包括造血組織中支持造血的結構成分,以及影響造血的調節因素,如果是骨髓當中沒有良好的造血微環境,造血干細胞無法生存,也是有可能導致再生障礙性貧血的。