消化內鏡包含胃鏡、十二指腸鏡、結腸鏡、雙氣囊小腸鏡、超聲胃鏡、超聲腸鏡和膠囊內鏡。雖然消化道從口腔開始直到肛門是連續的,但是不同部位需不同種類的內鏡。消化內鏡主要是為了檢查消化道是否存在疾病,以及具體的疾病情況。
如電子胃鏡檢查可以了解食道、胃、還有十二指腸的病變情況。小腸鏡主要是為了了解小腸病變。電子結腸鏡主要是為了了解整個大腸的病變情況。超聲內鏡是將內鏡和超聲相結合的消化道檢查技術,在內鏡直接觀察消化道黏膜病變的同時可利用內鏡下的超聲行實時掃描,獲得胃腸道的層次結構的組織學特征及周圍鄰近臟器的超聲圖像。膠囊內鏡被吞進消化道內,可以通過胃腸道的蠕動進行自動拍攝觀察消化道。