汗管瘤需要與毛發上皮瘤和扁平疣相鑒別。
毛發上皮瘤是向毛發結構分化的良性腫瘤,分化程度較基底細胞上皮瘤高。多發型為常染色體顯性遺傳,而單發型則無家族史。多發性毛發上皮瘤女性多見,常于幼年或青春期前發病,好發于面部,特別是鼻唇溝兩側,上唇周圍和眼瞼。皮損多發,直徑3-10mm,呈半球形,質地堅實,皮膚色、黃色或淡紅色。
扁平疣的皮損大多驟然出現,皮損為米粒至黃豆大扁平隆起的丘疹,表面光滑,質硬,淡褐色或正常膚色。圓形、橢圓形,數目比較多,零星分散或聚集成群。好發于顏面、手背等處。扁平疣是由于人類乳頭瘤病毒感染所引起,具有傳染性。