高催乳素血癥不會導致巧克力囊腫。垂體疾病是導致高催乳素血癥的重要原因。患者臨床以溢乳,月經紊亂,不孕,頭痛為主要癥狀。發病原因通常是下丘腦疾病以及垂體疾病,以垂體催乳素瘤最為常見,以及原發性甲狀腺功能減退和多囊卵巢綜合征,精神免疫性疾病,以及長期服用抗精神病藥物,抗憂郁藥物和抗高血壓藥物都會導致催乳素明顯升高或輕度升高。
而子宮內膜異位癥引起的子宮內膜在卵巢皮質內生長,可形成單個或多個囊腫,囊腫通常呈灰藍色,大小不一,內容物為陳舊性的血液聚集在囊內,形成咖啡色粘稠的液體,稱為巧克力囊腫,巧克力囊腫是由子宮內膜異位癥引起的。