臨床上心律失常的病因包括遺傳性和后天獲得性。遺傳性的心律失常多是因為基因突變導致的離子通道病,使心肌細胞離子流發生異常,常見的有先天性長QT間期綜合征、Brugada綜合征、早期復極綜合征等。后天性獲得性心律失常,包括生理性的原因如運動、情緒激動等引起的快速性心律市場以及睡眠狀態下導致的緩慢性心律失常,更多見于一些器質性心臟病如冠心病、高血壓心臟病等。
其他系統的疾病也可以導致心律失常的發生,如電解質紊亂、甲狀腺功能亢進等。這些疾病通過引起沖動的形成異常或者沖動的傳導異常,而導致心律失常的發生。