對于肝門膽管癌的腫瘤分期來說,應用較廣泛的是進行TNM分期,T主要是原發腫瘤的浸潤深度,N主要是指有無淋巴結的轉移,M主要是指有無遠處臟器的轉移。
對于患者的腫瘤大小以及腫瘤侵犯的層次來說,如果是位于患者膽管內,而且到達了肌層以及纖維組織,分為T1;如果患者腫瘤進一步達到周圍的脂肪組織以及侵犯鄰近的肝組織,多考慮為T2;如果患者進一步腫瘤侵犯門靜脈或者肝動脈的一側分支,多考慮為T3;如果腫瘤進一步生長,侵犯到門靜脈的主干,或者是雙側的分支,以及肝動脈等重要血管,這種情況下多考慮為T4。腫瘤的分期越高,患者的預后較差,而且患者5年生存率也較低。