反應性關節炎復發的概率是不好估計的,但是其復發僅占極少數的一部分患者。也就是說,大多數的患者經有效治療后,病情是可以得到明顯緩解,可以改善預后的。而且反應性關節炎這種疾病本身通常具有一定的自限性,在發病六周到八個月內,大多數患者的癥狀可以緩解,外周關節的功能也可以完全恢復,皮膚粘膜的損害也會恢復不遺留痕跡。當然也有部分患者由于感染灶的持續存在,或者又出現了一些新的感染,而導致了疾病的反復發作慢性遷延不愈,出現慢性復發性關節炎和虹膜炎,也可以導致關節畸形以及視力下降。
另外,也有某些慢性反應性關節炎患者,可以逐漸演變為其他的脊柱關節炎,比如強直性脊柱炎,銀屑病關節炎和腸病性關節炎等。因此,具體的復發概率是不好估計的,但是只要患者早期診斷,堅持早期進行積極有效的治療,大多數患者是可以得到病情緩解的。