肥厚型心肌病是不能夠治愈的,由于肥厚型心肌病病因不是特別明確,很多與遺傳基因有關系,是難以預防的。治療上主要是避免劇烈的運動,減少猝死的發生。治療的原則主要是嚴防肥厚的心肌,防止心動過速及維持正常的竇性心律,減輕左心室流出道狹窄和抗心律失常。
藥物治療主要使用β受體阻斷劑倍他樂克或比索洛爾,以及鈣通道阻滯劑維拉帕米或者是地爾硫卓。對于重癥梗阻性患者,可實行介入治療或手術治療。使用介入治療,通過注射無水酒精使肥厚的心肌壞死,達到切除肥厚的室間隔目的。避免使用洋地黃的藥物和擴張血管的藥物,主要是為了防止左室流出道梗阻。