甲狀腺功能減退的危害比較多,會累及多個系統,當累及心臟時會發生心臟病變和心包積液。患者的心臟增大,射血分數下降。臨床表現為心率緩慢、心音低鈍、心界擴大,合并大量心包積液者,心臟聽診有明顯的心音遙遠。患者如果累及呼吸系統,會發生阻塞性睡眠呼吸暫停綜合征,另外患者會發生多漿膜腔積液,見于心包腔、胸腔和關節腔。
最嚴重的并發癥就是甲狀腺功能減退危象,是甲狀腺功能減退患者最嚴重的并發癥,病死率可達20%以上。常見的誘因有各種感染、應激狀態、使用麻醉鎮靜劑及低溫、寒冷環境等。患者會出現低血壓、低血糖,還伴有低血鈉以及水中毒、呼吸抑制等。