線粒體腦肌病的存活時間與它的發病年齡和臨床表現密切相關,發病年齡越早,臨床的癥狀會越多,預后越差,活的時間越短。
線粒體腦肌病可發生于任何年齡階段,多呈慢性的進展過程。通常患者可以活幾十年,但是一般不會步入老年,就會出現多種的系統性的一些損害而危及生命。線粒體腦疾病其中的一些綜合癥多在20歲之前就會出現明顯的這種心臟的傳導阻滯現象。如果心臟的問題較為嚴重的話病情進展會比較快一些,多在20歲之前就會死于心臟病,而其他的一些像慢性進行性眼外肌癱瘓則是以慢性進展為主,多在40歲之后出現危及生命的狀況。