藥物流產對以后懷孕有一定的影響,一般防止感染使用抗生素之后影響會很小,相對于人工流產,藥物流產,它的優點是方法簡單,不需要宮內操作,無創傷。一般的副作用很輕,僅表現為惡心,嘔吐,下腹部痛和乏力,但是其遠期的副作用需要進一步的觀察,用藥之后應該嚴密的隨訪,出血量多的患者應該需要急診刮宮。
此外必須要重視異位妊娠,誤行藥物流產,甚至可導致休克,危及生命。藥物流產必須在正規有搶救條件的醫療機構實施,它適合于停經49日之內正常的宮內妊娠的患者流產。藥物流產之后口服抗生素,注意泌尿生殖道炎癥發生,然后就會減小它的副作用,一般也不會導致不孕癥。