抗癲癇的藥物可以通過胎盤進入胎兒體內,影響正在發育中的大腦,引起大腦本身和其他器官的發育障礙,更確切的機制目前尚不完全清楚。從目前的情況來看,幾乎全部常用的一線抗癲癇藥物都可能造成胎兒的畸形,幾乎胎兒的各個臟器均可以出現畸形,一般以中樞神經系統的畸形最為常見,如患兒表現為智力低下,面容的畸形,有時還出現神經管的畸形,如出現脊椎裂和顱裂,其他的器官如肢體,心臟也是經常出現畸形的部位。
父親服用抗癲癇藥物,對子女的影響不是很大,母親在早孕期間服用抗癲癇藥物,可能影響胎兒的發育。所以對于孕期的婦女來說,可以口服小劑量的葉酸以及復合維生素,有減少畸胎發生率的可能,但僅僅是減少,而不能完全避免。