琥乙紅霉素主要適用于肺炎支原體肺炎、沙眼衣原體引起的新生兒結膜炎、嬰兒肺炎、生殖泌尿道的感染、軍團菌病、白喉、皮膚軟組織感染、百日咳、敏感菌等,如流感、嗜血桿菌、肺炎球菌、溶血鏈球菌、葡萄球菌引起的呼吸道感染、鏈球菌咽峽炎、李斯德菌感染、風濕熱的長期預防及心內膜炎的預防、空腸彎曲菌腸炎、以及梅毒、淋病、痤瘡等。
小兒每日四次,口服是7.5到12.5毫克每公斤,或者每日兩次,每次15到25毫克每公斤,嚴重感染每日量可加倍分四次口服,百日咳的患兒每次口服10到12.5毫克每公斤,一日四次,療程為十四天。