急性咽峽炎常常以突然發熱以及咽痛為主要表現,可以影響吞咽,伴有流涎,發熱多為低度或者中等溫度的,也可以高達40度以上,甚至會引起抽搐,大概持續兩到四天,有時會有頭痛,腹痛或者肌肉痛,可以伴發嘔吐。
起初咽部是充血的,并伴有散在的灰白色的皰疹,四周環繞有紅暈,兩到三天以后,紅暈會加劇擴大,皰疹破潰,會形成黃色的潰瘍,數目多少不等,大致在五個左右。這種黏膜疹多見于扁桃體,軟腭,懸雍垂,但不見于齒齦,以及頰黏膜,和單純皰疹病毒引起的皰疹性的唇齦口炎不同,后者常終年可見,沒有季節性。
咽峽炎的全身癥狀和咽部體征一般在4到6天后可以自愈,偶有延長,大概到兩周左右的,很少有并發癥,有的時候會并發腮腺炎。